В 1994 году окончил Военную артиллерийскую академию имени М. И. Калинина.
С 1994 года служил в Дальневосточном военном округе: командир артиллерийского дивизиона, начальник штаба 996-го самоходно-артиллерийского полка.
С 1997 года — начальник штаба 147-го самоходно-артиллерийского полка в Московском военном округе.
С 1999 года — командир 99-го гвардейского самоходного артиллерийского полка 3-й мотострелковой дивизии 22-й общевойсковой армии Московского военного округа.
С сентября 1999 года принимал участие во второй чеченской войне, полк в составе оперативной группировки "Запад".
3 октября 1999 года в районе станицы Наурская два дивизиона под его командованием артобстрелом уничтожили до 70 боевиков и два автомобиля с боеприпасами.
Успешно руководил действиями полка при взятии Терского и Сунженского хребтов, населённых пунктов Верхний Наур, Самашки, Закан-Юрт, Алхан-Кала, Урус-Мартан, Гойты, Алхан-Юрт.
В январе 2000 года при штурме Грозного на наблюдательном пункте подвергся атаке, был отрезан от российских войск, и будучи окружён, вызвал огонь своих батарей на себя. В феврале 2000 года участвовал в операции по занятию Аргунского ущелья, где в боях на высоте 956,7 так же вызвал огонь на себя. В марте 2000 года участвовал в штурме села Комсомольское.
Указом Президента Российской Федерации № 1365 от 25 июля 2000 года гвардии полковнику Королькову Аркадию Михайловичу за мужество и героизм в ходе контртеррористической операции в Северо-Кавказском регионе присвоено звание Героя Российской Федерации
С 2002 года — начальник штаба - первый заместитель командира 34-й артиллерийской дивизии.
В 2006 году окончил Военную академию Генерального штаба.
С 2007 года — заместитель командующего ракетными войсками и артиллерией Московского военного округа.